Sie arbeitet mit Janice Kaplinski und Anna Holt zusammen.
Sie ist ein Teil der Gruppe, die zusammen mit James am Project Purity gearbeitet hat.
Nach dem aktivieren von Project Purity verschwindet Dr. Li aus dem Spiel. Von Daniel Agincourt erfährt man, dass Madison Li nach Norden aufgebrochen sei, um das Commonwealth zu suchen. Als sie dort ankommt, findet sie Das Institut und wird dort Abteilungsleiterin der Abteilung Fortschrittliche Systeme.